1、科目分类不同：鹈鹕别名塘鹅，是鹈形目、鹈鹕科、鹈鹕属动物；鹧鸪是鸡形目、雉科、鹧鸪属的鸟类。
2、生境分布不同：鹈鹕主要栖息于湖泊、江河、沿海和沼泽地带，以及荒芜的岛屿、泻湖，也光顾池塘和红树林；鹧鸪喜欢活动于次生林、低矮灌木林、杂木林，尤其喜欢生活在上有稀疏树木遮顶、下方有落叶草少的环境。
3、形态特征不同：鹈鹕嘴形宽大直长，上嘴尖端朝下弯曲，呈钩状；下嘴分左右二支，其间有一巨大而能扩缩的皮肤喉囊；全身长有密而短的羽毛，羽毛为桃红色或浅灰褐色。鹧鸪身体上的羽毛除颏、喉部为白色外，黑黑的体羽上点缀着一块块卵圆色的白斑，上体的较小，下体的稍大，下背和腰部布满了细窄而呈波浪状的白色横斑。