特种兵穿越古代的电影叫《天军》。该片讲述了韩国和朝鲜共同隐秘制作的核武器飞激震天雷”被定为转让到美方。对此不满的朝鲜少校江民吉金承佑饰)挟持了核物理家金秀燕孔孝珍饰)，并且想把飞激震天雷”带走。这时，433年以来第一次经过地球的彗星刚好通过朝鲜半岛的上空。江民吉一行人和追捕的韩国少校朴正宇黄政民饰)一行人在鸭绿江对持中，与突然刮起的旋风一起消失了。
旋风消失以后，他们睁开眼看到的是女真族的杀戮现场。他们本能的拿起了枪，看到现代武器的女真族被吓跑了。一行人躲到了山洞里，当天晚上有个人来偷他们的武器。他就是落榜以后过着放荡生活的李舜臣朴重勋饰)。这时传开了天军从天而降的消息，他们来到的是1572年的朝鲜边防村庄。在与女真族的战斗中丢失了飞激震天雷”，朝鲜军人为此离开。
同时，朴正宇对李舜臣非常失望想再次训练李舜臣，不过李舜臣坚持不肯学。此时村里的一个少女被女真族杀害了，这时李舜臣逐渐显示出了英雄本色。夺回飞激震天雷”以后女真族对村庄开始了进攻，这时金秀燕找到了回到未来的方法，现在他们要决定的是回去还是留下来与李舜臣一起对抗女真族。