半自主复制说的半自主不是只DNA分子，而且只线粒体或叶绿体的整体结构是半自主的。线粒体或叶绿体有自己的DNA，有自己的核糖体，可以自己合成蛋白质，但是这些蛋白质只是线粒体或叶绿体所有蛋白质的一部分，需要细胞核基因的转录翻译提供的其他蛋白质，所有线粒体或叶绿体是半自主复制。
线粒体是一种存在于大多数细胞中的由两层膜包被的细胞器，是细胞中制造能量的结构，是细胞进行有氧呼吸的主要场所。其直径在零点五到一微米左右。
叶绿体是植物细胞内最重要、最普遍的质体，它是进行光合作用的细胞器。叶绿体利用其叶绿素将光能转变为化学能，把二氧化碳与水转变为糖。