1、定义不同：
组织机构代码是专有名词，机构编码不是。组织机构代码是对中华人民共和国内依法注册、依法登记的机关、企事业单位、社会团体，以及其他组织机构颁发一个在全国范围内唯一的、始终不变的代码标识。国家质检总局负责组织机构代码的管理工作。
2、严谨性不同：
“组织机构代码”的用语更严谨。“机构编码”这个词具有随意性、模糊性、不确定性。“组织机构代码”的用语更严谨，指向性更明确。
3、编码规则不同：
组织机构代码的全国组织机构代码由八位数字(或大写拉丁字母)本体代码和一位数字(或大写拉丁字母)校验码组成。机构编码一般是按企业的规则自行制定的。
扩展资料：
全国组织机构代码管理中心表示，将认真贯彻落实国务院常务会议精神，从七个方面将《总体方案》中的相关要求落到实处。
做好工作职能的转变。统一代码方案实施后，组织机构代码将作为统一社会信用代码的主体标识存在，不再单独向法人和其他组织发放组织机构代码证，已发的组织机构代码证也不再年检、换证和收费。