赤井秀一知道柯南就是新一。赤井秀一是《名侦探柯南》里一位喜欢戴针织帽的神秘FBI搜查官，开始无论是在漫画，还是动画片里，一直没有很明显的说明他知道柯南就是新一，这正是片子的独到之处。直到最新的漫画，才正式揭晓了谜题。
名侦探柯南是很多人都喜欢的一部日本侦探推理动漫，每一集的故事设定都很出色，让人看得很过瘾。赤井秀一的第一次出场，应该是在《迷一样的乘客》那一级，按照故事里的时间来说，秀一是在纽约事件中第一次出现的，但是当时他和新一并没有见面，只是见到了小兰。
赤井秀一曾经是黑衣组织的成员，后来成为优秀的FBI探员，平日里他化妆成冲矢昴，主要负责调查黑暗组织。在漫画的最新的话里，谜题终于被揭晓了，这一次秀一没有化妆成冲矢昴，他打电话给弟弟的专用手机，告诉弟弟“和某一个高中生侦探一样，他公开的身份已经死了”，他嘴里所说的高中生侦探明显就是工藤新一。
如此看来，赤井秀一应该很早就知道柯南的身份了，他在住进工腾家之后，就对这个小学生很好奇“这个小孩也太聪明了”，并且他本来就知道灰原哀变小的事情，所以他知道柯南就是工藤新一并不奇怪。