借条没有借款人手印是有瑕疵的，但是不影响其效力，仍然是有效的。建议大家在书写借条时尽量正规，落款处借款人亲笔书写其真实姓名并书写日期，摁手印。虽然有借款人亲笔书写的姓名，即使借款人不承认也可以进行笔迹鉴定来辨别，但是如果有指纹，再进行指纹比就对更稳妥。另外，在借款人下落不明的情况下，可以通过公安机关备案的指纹信息与借条指纹比对，更有利于债权债务关系的确认。
法律依据：
《合同法》第一百九十七条
借款合同采用书面形式，但自然人之间借款另有约定的除外。借款合同的内容包括借款种类、币种、用途、数额、利率、期限和还款方式等条款。