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因为新疆生产建设兵团承担着国家赋予的维稳戍边职责，实行党政军企合一体制，在自己所辖垦区内，依照国家和新疆维吾尔自治区的法律、法规，自行管理内部行政、司法事务，受中央政府和新疆维吾尔自治区双重领导，在国家实行计划单列的特殊社会组织，是国务院计划单列的省（部）级单位，享有省级的权限。其中，屯垦戍边是中国几千年开发和保卫边疆的历史遗产。中央政府在西域新疆大规模屯垦戍边始于2000多年前的西汉，以后历代沿袭。
