1、地形特点：
阿勒泰地区地貌类型复杂多样，主要划分为山地、丘陵、平原和沙漠。山区面积约占四分之五。阿尔泰山山脊线沿中哈、中俄、中蒙边界连绵800多千米，位于中蒙边境上的友谊峰，主峰海拔4374米。阿勒泰地区主要河流均发源于阿尔泰山地。位于地区西部的萨吾尔山脉，横贯吉木乃县与和布克赛尔蒙古自治县交界处，主峰木斯岛山海拔3835米。丘陵主要分布在山麓缓坡地带和准噶尔盆地东北部，其间矿苗外露，易于开采，是地区主要成矿区域。平原分布在额尔齐斯河河谷、乌伦古河河谷及其他河流中下游。沙漠分布于福海县、富蕴县南部及哈巴河县、布尔津县、吉木乃县局部地区。最低海拔317米（富蕴县三个泉洼地）。
2、气候特点：
阿勒泰地区地处欧亚大陆腹地，纬度较高，属典型的温带大陆性寒冷气候，其特点是夏季干热，冬季严寒，平原地区降水量少，蒸发量大，昼夜温差大，光照充足，全年多季风。年均气温0.7℃—4.9℃，极端最低温度-51.5℃，极端最高温度42.2℃。平原地区年均降水量131—223毫米，年蒸发量1367—2066毫米，无霜期123—152天，全年日照时数2829—3045小时。
3、生物资源特点：
阿勒泰地区野生动植物物种丰富，全地区野生植物有1378种，药用植物种类200多种，其中许多为名贵药材。珍稀濒危植物有蒙古黄芪、草苁蓉、肉苁蓉、新疆阿魏等，特有植物有鹿根、额河菱角、欧亚萍蓬草、阿勒泰赤芍、阿尔泰金莲花、阿尔泰低头葱等。有野生动物466种，其中被列为国家级保护动物的有74种（一级的20种，二级的54种），省级的36种。濒危动物有雪豹、北山羊、盘羊、野驴、马鹿、原麝和在中国仅分布于阿勒泰地区的河狸。